目的利用生物信息學分析初步
探索頸動脈粥樣硬化進展的樞紐基因和關鍵通路。方法從GEO
數據庫獲得頸動脈斑塊的基因表達譜GSE43292數據集,利用GEO2R分析頸動脈斑塊和正常組織的差異基因,利用R語言clusterprofile包對差異基因進行GO富集分析和KEGG功能富集分析。利用STRING工具和Cytoscape構建蛋白互作網絡,并篩選關鍵基因。結果GEO2R分析GSE43292數據集共含有97個差異基因,包括46個上調基因和51個下調基因;基因富集分析發現差異基因主要富集cAMP信號通路、色氨酸代謝、PPAR信號通路等相關通路。差異基因蛋白互作網絡的樞紐基因為CD163、MMP9、CXCL10、CCR1。結論CD163、MMP9、CXCL10、CCR1為頸動脈斑塊形成的樞紐基因,可能為動脈粥樣斑塊的預后和治療提供新的分子靶點。